152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34380  ketopantoate reductase  100 
 
 		 368 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0495871  normal  0.346815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3557  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  34.05 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6340  2-dehydropantoate 2-reductase  32.77 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  34.22 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.45 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  34.76 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.53 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  34.41 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  26.41 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  33.18 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  32.96 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  34.25 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  33.16 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  28.5 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.92 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  36.59 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  32.82 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  31.18 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  28.69 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  38.1 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  28.63 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  37.29 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.43 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  30.81 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 		 332 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  37.72 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.68 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  26.8 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 		 314 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 325 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.44 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.84 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  26.84 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.31 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  38.83 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  34.96 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  22.08 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 326 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 		 331 aa  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  28.89 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  27.35 
 
 		 321 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  38.83 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  38.46 
 
 		 627 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  27.6 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2539  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>