More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2951 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 305 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  99.02 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  99.02 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  99.34 
 
 		 305 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  98.69 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  47.37 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  47.37 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  46.89 
 
 		 337 aa  281  8.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  43.46 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  41.64 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  38.89 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 		 311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  38.83 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  38.83 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  36.67 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  36.13 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1333  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.782684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  35.99 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  38.02 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  35.76 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  38.02 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  38.02 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  37.7 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  34.39 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  38.22 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  37.7 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  35.03 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  37.9 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  37.38 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  35.35 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  35.35 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1867  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  31.11 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.16 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  32.21 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 		 345 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0258  ketopantoate reductase  29.34 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.466283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.46 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.71 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  28.89 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  27.69 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  29.74 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  28.76 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  26.8 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.84 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  24.43 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  29.21 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  25.8 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  27.14 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.76 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  26.92 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>