287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1927 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 370 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2539  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 376 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  91.52 
 
 		 351 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2457  2-dehydropantoate 2-reductase  85.71 
 
 		 351 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000431048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5870  2-dehydropantoate 2-reductase  88.64 
 
 		 348 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166245  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2587  2-dehydropantoate 2-reductase  85.71 
 
 		 351 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438378  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  64.78 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  68.67 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  68.67 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2141  2-dehydropantoate 2-reductase  67.67 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2264  2-dehydropantoate 2-reductase  67.67 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0940  2-dehydropantoate 2-reductase  67.67 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0561  2-dehydropantoate 2-reductase  67.67 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1092  2-dehydropantoate 2-reductase  67.67 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0936  2-dehydropantoate 2-reductase  67.33 
 
 		 340 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0749  2-dehydropantoate 2-reductase  67.67 
 
 		 340 aa  348  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  57.84 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3175  2-dehydropantoate 2-reductase  52.12 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  45.89 
 
 		 330 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1772  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0800  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1081  2-dehydropantoate 2-reductase  37.05 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 		 301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 		 301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 		 301 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.13 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  33.98 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 		 298 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.97 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32.03 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 316 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.68 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  31.95 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 		 345 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.47 
 
 		 309 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 323 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  24.52 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  25.39 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  22.56 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  26.74 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  20.62 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  26.2 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.38 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  26.65 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  33.69 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  33.69 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  25.55 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  31.98 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  26.49 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  25.6 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  30.83 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  24.05 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  31.47 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  23.26 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  30.22 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  26.05 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  23.26 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.88 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  21.15 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>