More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3687 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
302 aa  584  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  66.01 
 
 
310 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  59.8 
 
 
294 aa  297  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  61.31 
 
 
302 aa  288  8e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  58.61 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  38.69 
 
 
309 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  35.67 
 
 
301 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  37.21 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  37.5 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.55 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  34.44 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  36.09 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  36.72 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
295 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  34.11 
 
 
314 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.77 
 
 
325 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  36.39 
 
 
319 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.45 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 
315 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  34.94 
 
 
305 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  36.01 
 
 
306 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
307 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 
345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  34.64 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
313 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  31.39 
 
 
312 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 
296 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  35.03 
 
 
303 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  34.62 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  29.04 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  32.37 
 
 
327 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 
307 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  39.24 
 
 
296 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 
326 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 
303 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 
335 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 
307 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  28.06 
 
 
307 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
318 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  32.25 
 
 
303 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.21 
 
 
306 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 
307 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 
303 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 
301 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 
303 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 
303 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 
301 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  34.01 
 
 
303 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  31.7 
 
 
306 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 
310 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
315 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  35.2 
 
 
303 aa  106  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.07 
 
 
315 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
318 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
316 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 
309 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
316 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 
327 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 
324 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 
303 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
316 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  35.64 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 
312 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
319 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 
309 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
320 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 
341 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
316 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  33.01 
 
 
316 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 
343 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 
329 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>