More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4968 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  90.43 
 
 
303 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  71.1 
 
 
303 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  67.56 
 
 
305 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  69.02 
 
 
297 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  65.33 
 
 
305 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  63.67 
 
 
305 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  65 
 
 
305 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  63.79 
 
 
306 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  64.67 
 
 
305 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  63 
 
 
306 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  37.71 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  34.69 
 
 
296 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 
296 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.11 
 
 
303 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  143  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  33.68 
 
 
303 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 
303 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
302 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
296 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  35.31 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  34.49 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  37.21 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  33.82 
 
 
310 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  34.49 
 
 
327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  34.88 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 
311 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  33.57 
 
 
327 aa  122  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  35.43 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 
299 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  25.68 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
298 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
315 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
280 aa  102  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  32.72 
 
 
285 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  32.4 
 
 
307 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
300 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  31.47 
 
 
306 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  32.99 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  31.41 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
309 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  28.74 
 
 
424 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  27.4 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  32.88 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  28.17 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  26.63 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30.64 
 
 
345 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  26.09 
 
 
337 aa  87  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.74 
 
 
302 aa  86.3  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  25.84 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  32.74 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>