More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0497 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
303 aa  627  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  99.67 
 
 
303 aa  624  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  99.67 
 
 
303 aa  624  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  99.34 
 
 
303 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  99.34 
 
 
303 aa  621  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  99.34 
 
 
303 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  99.34 
 
 
303 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  99.34 
 
 
303 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  99.01 
 
 
303 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  87.46 
 
 
303 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  87.13 
 
 
303 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  87.13 
 
 
303 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  87.13 
 
 
303 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  87.13 
 
 
303 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  80.86 
 
 
303 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  64.69 
 
 
303 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  62.71 
 
 
303 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  62.71 
 
 
303 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  62.71 
 
 
303 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  63.37 
 
 
302 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  62.71 
 
 
302 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  59.15 
 
 
306 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  59.08 
 
 
302 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  51.55 
 
 
289 aa  292  5e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  39.6 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  42.33 
 
 
296 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  39.8 
 
 
299 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  37.87 
 
 
296 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  34.02 
 
 
294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 
303 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  35.81 
 
 
343 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  35.53 
 
 
310 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
294 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  35.26 
 
 
311 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 
320 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 
312 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  34.82 
 
 
311 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
297 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  34.39 
 
 
313 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  34.97 
 
 
312 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  33.9 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  35.16 
 
 
324 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
305 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  34.62 
 
 
305 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  35.09 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  33.91 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 
306 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
327 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  32.21 
 
 
306 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
306 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 
293 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  32.09 
 
 
424 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
296 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  26.26 
 
 
294 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 
309 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  27.51 
 
 
296 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 
316 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 
280 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 
318 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  26.37 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.91 
 
 
311 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 
311 aa  92.4  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  25.64 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  25.64 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
303 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 
309 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 
314 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.69 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
301 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  27.17 
 
 
357 aa  89.4  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.57 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.14 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>