274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2147 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
303 aa  604  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  38.85 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  37.21 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 
305 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
296 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  35.48 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  35.74 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  35.67 
 
 
306 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  38.21 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
297 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  34.74 
 
 
305 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 
296 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  37.24 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  30.26 
 
 
303 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 
305 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
306 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  32.73 
 
 
294 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.32 
 
 
311 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.87 
 
 
294 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 
296 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
343 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
312 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 
311 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  32.4 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  29.21 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
303 aa  92.4  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  31.89 
 
 
314 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
303 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  28.38 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
303 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
303 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
303 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
303 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 
303 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
303 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
303 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  31.88 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  30.14 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  38.16 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 
326 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  28.17 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  28.45 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.55 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  32.91 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  32.28 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  31.62 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  32.6 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  32.2 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.01 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  23.69 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  25.45 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  23.9 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  23.75 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  32.7 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>