More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0958 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  39.51 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  37.25 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  35.76 
 
 
296 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  37.25 
 
 
305 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  37.71 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
303 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
303 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
303 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
303 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  36.27 
 
 
303 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  35.93 
 
 
303 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  35.93 
 
 
303 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  34.97 
 
 
305 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  34.34 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  34.85 
 
 
305 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  36.49 
 
 
297 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.03 
 
 
303 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  34 
 
 
296 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
303 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  32.54 
 
 
303 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  32.65 
 
 
302 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  32.99 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
312 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 
303 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 
303 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 
303 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  34.88 
 
 
303 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 
302 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 
299 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  31.84 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  35.48 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  31.23 
 
 
357 aa  112  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  32.05 
 
 
424 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 
313 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
311 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  30.35 
 
 
327 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
310 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
300 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  32.21 
 
 
302 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
310 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  30.29 
 
 
320 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 
319 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 
326 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  31.62 
 
 
299 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  29.88 
 
 
326 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
301 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 
289 aa  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  36.6 
 
 
307 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
294 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
324 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.49 
 
 
302 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 
327 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.8 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  30.64 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
311 aa  92.8  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.41 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
345 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 
306 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
316 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
316 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  30.35 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 
316 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 
317 aa  89  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 
303 aa  89  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>