More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3080 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
306 aa  627  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  78.43 
 
 
302 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  76.8 
 
 
302 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  77.12 
 
 
302 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  66.99 
 
 
303 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  66.99 
 
 
303 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  66.99 
 
 
303 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  65.03 
 
 
303 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  60.13 
 
 
303 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  59.8 
 
 
303 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  59.8 
 
 
303 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  59.8 
 
 
303 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  59.8 
 
 
303 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  59.48 
 
 
303 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  59.48 
 
 
303 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  59.48 
 
 
303 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  59.48 
 
 
303 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  59.48 
 
 
303 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  59.48 
 
 
303 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  59.48 
 
 
303 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  60.71 
 
 
303 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  59.15 
 
 
303 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  58.82 
 
 
303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  50.68 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  40.26 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  40.98 
 
 
296 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  38.33 
 
 
296 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  38.03 
 
 
299 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  37.95 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  35.15 
 
 
294 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  37.79 
 
 
326 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  37.79 
 
 
326 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  37.86 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  35.5 
 
 
312 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  36.19 
 
 
343 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  36.96 
 
 
324 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  36.25 
 
 
327 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  35.83 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  35.48 
 
 
320 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  34.84 
 
 
312 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  35.05 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  36.6 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  34.6 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  34.72 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  35.14 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  31.74 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  36.33 
 
 
303 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  33.78 
 
 
297 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 
296 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 
294 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
295 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
295 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  32.99 
 
 
306 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
310 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 
296 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.7 
 
 
302 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
280 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  30.07 
 
 
424 aa  92.4  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  33.05 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  26.01 
 
 
318 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 
296 aa  89  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  23.55 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 
303 aa  85.5  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  29.29 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.53 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  25.4 
 
 
311 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  25.4 
 
 
311 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  24.18 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>