More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2003 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 280 aa  546  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  57.82 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  51.62 
 
 		 278 aa  275  4e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  53.93 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  54.09 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.77 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  33.57 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  34.16 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  33.2 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 317 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  40.97 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 311 aa  95.5  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  26.51 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  30.03 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  29.59 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  29.59 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  29.59 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  29.59 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  29.59 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  30.93 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  29.59 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 		 302 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  30.29 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.1 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  44.92 
 
 		 296 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  31.76 
 
 		 336 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 327 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  42.74 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  35.96 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  25.68 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 		 306 aa  85.5  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  38.19 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 		 303 aa  85.5  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  30.95 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  32.84 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  41.13 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  30.27 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  32.64 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.8 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  27.5 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  32.29 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  23.87 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.9 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  23.79 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>