More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3920 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
295 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  74.92 
 
 
299 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  72.64 
 
 
298 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  72.67 
 
 
313 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  70 
 
 
317 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  64.9 
 
 
305 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  66.89 
 
 
345 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  63.51 
 
 
319 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  63.18 
 
 
319 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  63.3 
 
 
325 aa  344  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  56.61 
 
 
301 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  54.58 
 
 
300 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  54.27 
 
 
299 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  53.72 
 
 
301 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  53.72 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  55.83 
 
 
296 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  40.2 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  38.36 
 
 
316 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  38.36 
 
 
316 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  38.94 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  37.29 
 
 
316 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  37.29 
 
 
316 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  36.33 
 
 
315 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 
335 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 
305 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 
305 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  37.29 
 
 
315 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 
305 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  36.77 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 
305 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
305 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 
341 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
315 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  34.54 
 
 
313 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 
312 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  34.88 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  34.85 
 
 
314 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  37.29 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 
307 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  34.87 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  32.17 
 
 
310 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  35.39 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  34 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
309 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  32.68 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  32.44 
 
 
309 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  32.45 
 
 
309 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 
302 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
311 aa  125  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  33.97 
 
 
318 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.97 
 
 
318 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  33.97 
 
 
318 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 
311 aa  123  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  31.41 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  33.65 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  35.22 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  33.65 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  29.74 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  32.34 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
342 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.29 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 
318 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  33.97 
 
 
318 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 
324 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 
307 aa  116  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
306 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 
353 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 
295 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 
332 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 
314 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 
289 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  28.2 
 
 
312 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
311 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
312 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 
351 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
322 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  28.17 
 
 
335 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  31.41 
 
 
314 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>