More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0383 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 280 aa  546  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  57.25 
 
 		 278 aa  334  9e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  57.82 
 
 		 280 aa  296  3e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  54.51 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  53.19 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  35.81 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  44 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  36.67 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  37.77 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  37.63 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  34.8 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  30.9 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.64 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 329 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  34.02 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  34.93 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.12 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  34.09 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  37.12 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 		 317 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  26.8 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.7 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 309 aa  98.6  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  32.65 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  26.51 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.17 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  31.67 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  32.85 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  32.66 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  32.68 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 311 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 		 335 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  34.13 
 
 		 306 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.95 
 
 		 311 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.91 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  28.81 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 303 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  27.95 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 		 327 aa  88.6  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 303 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  33.89 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>