More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0296 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
309 aa  600  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  54.87 
 
 
310 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  58.61 
 
 
302 aa  290  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  57.19 
 
 
294 aa  273  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  57 
 
 
302 aa  261  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  34.11 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 
300 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.78 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  31.84 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
314 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  35.62 
 
 
310 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  38.23 
 
 
336 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
313 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25.17 
 
 
307 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 
319 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  33.65 
 
 
319 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  32.07 
 
 
307 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 
298 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
307 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.68 
 
 
345 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
313 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
318 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
318 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
318 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
310 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 
307 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
318 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
316 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
316 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
317 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
318 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
329 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  35.64 
 
 
307 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  35.14 
 
 
314 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
341 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 
310 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.67 
 
 
312 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  28.2 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.38 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  34.5 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  30.49 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  35.23 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  34.5 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  34.86 
 
 
296 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  31.99 
 
 
306 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 
296 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  32.03 
 
 
316 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.05 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
312 aa  93.2  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  32.91 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 
306 aa  92.8  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  32.41 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  28.67 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.39 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.26 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
306 aa  89  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  32.55 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.28 
 
 
337 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 
305 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 
303 aa  87  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 
309 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  28.76 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  31.7 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  28.19 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  25.91 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.42 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  23.75 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>