More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1698 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  82.24 
 
 		 309 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  56.77 
 
 		 303 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  57.62 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  51.16 
 
 		 302 aa  310  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  38.87 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  32.7 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.73 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.27 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  25.4 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  26.18 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.18 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.84 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.84 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  27.48 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  25.8 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  25.49 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  27.07 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  26.9 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  23.87 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  23.05 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6340  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  28.68 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  25.69 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  24.12 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  28.31 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  28.31 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.96 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  23.79 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  24.75 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  25.73 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  23.64 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 		 341 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  24.38 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  27.87 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  24.37 
 
 		 314 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  28.97 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 		 336 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  25.73 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  23.47 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  24.22 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  25.93 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  22.51 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  23.47 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  23.93 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.34 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  23.93 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  24.35 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  26.86 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  23.93 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  23.61 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>