More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0713 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
306 aa  613  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  42.11 
 
 
318 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  43.14 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  42.47 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  40.2 
 
 
299 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  41.2 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  39.44 
 
 
315 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  37.79 
 
 
301 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  38.38 
 
 
311 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  39.18 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 
307 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  39.29 
 
 
299 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  37.79 
 
 
298 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  36.79 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  35.55 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  36.45 
 
 
301 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  36.12 
 
 
295 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
314 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 
317 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  34.33 
 
 
345 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 
314 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 
314 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  26.92 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  35.33 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 
314 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 
314 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 
314 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  35 
 
 
319 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  25.87 
 
 
314 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  34.04 
 
 
306 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  25.87 
 
 
314 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 
314 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 
307 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  34.58 
 
 
332 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.85 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
325 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  35.45 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  34.16 
 
 
332 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  34.17 
 
 
317 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  34.91 
 
 
336 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  34.59 
 
 
335 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 
317 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 
310 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  33.89 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
326 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  32.27 
 
 
316 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  31.78 
 
 
346 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 
308 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
341 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  34.27 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.38 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  32.38 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  30.91 
 
 
324 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  32.41 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.59 
 
 
316 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.59 
 
 
316 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.89 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  32.15 
 
 
319 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  30.91 
 
 
353 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 
312 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 
305 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  31.29 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.7 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 
312 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  30.26 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  31.88 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 
335 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 
335 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 
311 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 
326 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 
326 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 
326 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 
315 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  31.95 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 
311 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 
324 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 
311 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  30.85 
 
 
325 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.42 
 
 
311 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  30.17 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  32.88 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  33.64 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  30.32 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 
336 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
315 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>