More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1361 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  64.9 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  65.23 
 
 		 298 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  64.38 
 
 		 317 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  62.25 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  61.13 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  60.53 
 
 		 345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  62 
 
 		 325 aa  332  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  57.24 
 
 		 319 aa  318  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  57.24 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  51.66 
 
 		 301 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  52.65 
 
 		 300 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  51.16 
 
 		 299 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  51.82 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  51.82 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  55.02 
 
 		 296 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  41.2 
 
 		 311 aa  231  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  38.02 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  36.28 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.59 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  37.34 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  37.34 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  37.34 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  35.5 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  35.5 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  35.5 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  36.13 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  35.16 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  35.95 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  34.39 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  35.02 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  38.28 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  34.09 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  32.75 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.66 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.39 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  32.66 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  34.42 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  35.16 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  30.32 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  26.49 
 
 		 312 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.29 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  26.43 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  26.43 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.86 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.55 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  34.35 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 324 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 315 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.13 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  27.85 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  33.13 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  33.13 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  29.01 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  32.93 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  29.86 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  32.82 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  34.04 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>