More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
315 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  86.98 
 
 
315 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  67.68 
 
 
315 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  68.37 
 
 
317 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  70.51 
 
 
317 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  67.68 
 
 
349 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  67.94 
 
 
315 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  67.3 
 
 
315 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  64.74 
 
 
323 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  63.61 
 
 
323 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  41.99 
 
 
313 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  41.69 
 
 
312 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  39.87 
 
 
319 aa  235  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  43.56 
 
 
302 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  45.39 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 
305 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  36.86 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  38.34 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  32.73 
 
 
414 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 
319 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25.65 
 
 
301 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 
319 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  33.57 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 
319 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 
300 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 
307 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
325 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
345 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
311 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 
298 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  23.36 
 
 
426 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 
318 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08718  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02620)  22.88 
 
 
711 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
316 aa  92.8  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.45 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  27.45 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  25.83 
 
 
335 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  25.23 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  25.23 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  31.75 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  31.75 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.75 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34207  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  22.95 
 
 
351 aa  86.3  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391649  normal  0.984982 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 
318 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  31.75 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  24.5 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01220  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  24.36 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.38 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08494  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 
389 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  28.23 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  28.06 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  29.79 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  25.61 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  24.31 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  25.23 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  25.09 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  25.93 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  24.62 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.43 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  28.89 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  25.91 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  28.14 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  25.56 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>