More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2276 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
323 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  85.45 
 
 
323 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  70.03 
 
 
317 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  67.94 
 
 
315 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  67.62 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  67.09 
 
 
349 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  66.56 
 
 
315 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  64.71 
 
 
315 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  64.4 
 
 
317 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  63.42 
 
 
315 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  44.3 
 
 
313 aa  259  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  41.35 
 
 
312 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  41.59 
 
 
319 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  42.19 
 
 
302 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  41.67 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  37.99 
 
 
305 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  39.94 
 
 
312 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  37.8 
 
 
311 aa  190  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  34.42 
 
 
312 aa  182  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  35.29 
 
 
319 aa  159  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  29.75 
 
 
414 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.63 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  27.05 
 
 
426 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  33.72 
 
 
311 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  32.28 
 
 
319 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.74 
 
 
307 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 
345 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.12 
 
 
307 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  27.98 
 
 
336 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 
299 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08718  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02620)  25.08 
 
 
711 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 
337 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
295 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  26.81 
 
 
326 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  27.92 
 
 
313 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  25.67 
 
 
335 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 
335 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
298 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  25.79 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  25.79 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  28.86 
 
 
325 aa  99  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
324 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 
300 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  25.29 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  27.64 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.9 
 
 
317 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08494  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
389 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34207  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  22.22 
 
 
351 aa  93.6  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391649  normal  0.984982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.8 
 
 
305 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 
314 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
332 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
353 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
312 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
323 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
341 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 
280 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.3 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  25.66 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  25.76 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  27.95 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  24.66 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  26.53 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  25.78 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  25.95 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>