More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0552 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
319 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  43.96 
 
 
312 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 
313 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
311 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  35.26 
 
 
315 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  36.39 
 
 
315 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  36.05 
 
 
349 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
323 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  34.13 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
317 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  35.81 
 
 
323 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  32.23 
 
 
302 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  33.65 
 
 
317 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
302 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 
315 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  30.51 
 
 
367 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  27.33 
 
 
414 aa  125  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08718  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02620)  26.6 
 
 
711 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  27.27 
 
 
426 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  27.5 
 
 
325 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
333 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08494  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 
389 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  26.15 
 
 
326 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
331 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  25.85 
 
 
326 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34207  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  27.93 
 
 
351 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391649  normal  0.984982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  25.54 
 
 
326 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 
325 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 
300 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 
299 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 
317 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  24.34 
 
 
309 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63020  predicted protein  25.49 
 
 
365 aa  99.4  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.420231  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  25.91 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  25.91 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  25.3 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03630  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 
374 aa  95.9  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01220  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  26.22 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 
313 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  27.86 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
312 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  24.26 
 
 
301 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  27.55 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 
345 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  26.47 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 
335 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 
332 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  26.81 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 
319 aa  87  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
295 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 
319 aa  87  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  27.86 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  24.16 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.23 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  27.95 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  25.24 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  25.24 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  25.24 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>