More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0294 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 307 aa  626  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  39.74 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  38.08 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  35.44 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  36.14 
 
 		 314 aa  178  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  35.09 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  35.09 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  35.44 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  34.74 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  34.74 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  34.74 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  37.28 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  35.74 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  32.12 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  37.17 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  35.08 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  35.83 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  34.54 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  35.51 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  40.4 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  32.48 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  30.26 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  33.33 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.67 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.39 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.03 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  35.61 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  33.84 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  27.53 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  25.17 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  27.57 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  25.61 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.57 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  26.99 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  25.46 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  26.82 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  24.09 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 		 339 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25.58 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  24.14 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  26.45 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>