259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39578 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  100 
 
 
414 aa  861    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 
302 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  33.03 
 
 
302 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 
312 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 
313 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  32.32 
 
 
315 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
311 aa  140  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 
305 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 
323 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 
312 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 
315 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 
317 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  30.39 
 
 
317 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
319 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  27.25 
 
 
327 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  26.47 
 
 
324 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  25.98 
 
 
300 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  26.46 
 
 
312 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  25.07 
 
 
325 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  24.79 
 
 
325 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  24.21 
 
 
325 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  25.07 
 
 
299 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  24.49 
 
 
325 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  25.96 
 
 
306 aa  86.3  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.82 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.07 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 
324 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  23.8 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  25.36 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  26.47 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  26.65 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  24.78 
 
 
329 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  24.72 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  25.14 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  24.69 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  23.94 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  24.33 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  22.82 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  24.78 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  24.2 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  24.69 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  25.51 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  25.72 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  25.72 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  25.36 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  24.48 
 
 
307 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  39.47 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  39.47 
 
 
312 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  24.71 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  24.71 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  24.71 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  24.71 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  24.71 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  24.86 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 
307 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  25.61 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  24.35 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  24.35 
 
 
329 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  26.65 
 
 
295 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  24.78 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  37.96 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  23.39 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  23.46 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  25.37 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  23.21 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  35.54 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  39.81 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  38.32 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  34.51 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  34.51 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  23.68 
 
 
326 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  34.51 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  23.91 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  25.45 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  34.51 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  25.37 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  24.57 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  24.57 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  25.35 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  24.13 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  23.78 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  34.51 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>