More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6024 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 325 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  96 
 
 		 325 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  77.23 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  75.7 
 
 		 335 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  74.45 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  64.31 
 
 		 346 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  66.98 
 
 		 353 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  65.73 
 
 		 324 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  64.17 
 
 		 324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  63.78 
 
 		 326 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  62.31 
 
 		 324 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  62.11 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  61.68 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  53.75 
 
 		 323 aa  342  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 447 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  49.07 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  50.62 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  50.78 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  49.53 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 		 333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  49.06 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  47.98 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  50.33 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  48.06 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  47.46 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  47.46 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  47.8 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  40.94 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  42.19 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  44.69 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  41.88 
 
 		 326 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  43.57 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  45.48 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  41.25 
 
 		 326 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  44.06 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  41.46 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  42.41 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  40.82 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  40.19 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  40.75 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  40.49 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  40.44 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  40.44 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  40.44 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  40.44 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  38.87 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  39.94 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  40.25 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  40.92 
 
 		 332 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  38.34 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  39.69 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  40.31 
 
 		 332 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  40.31 
 
 		 332 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  40.31 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  40.62 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  39.51 
 
 		 334 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  35.83 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  39.11 
 
 		 223 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  31.87 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.23 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.4 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.91 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 302 aa  99.4  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 345 aa  99  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.91 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.6 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>