More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3341 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 324 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  99.69 
 
 		 329 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  99.69 
 
 		 329 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  99.69 
 
 		 329 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  99.07 
 
 		 329 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  98.17 
 
 		 333 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  96.99 
 
 		 337 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  90.74 
 
 		 329 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  75.31 
 
 		 332 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  74.69 
 
 		 332 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  74.07 
 
 		 332 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  74.07 
 
 		 332 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  73.15 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  73.15 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  71.3 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  55.56 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  55.25 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  54.94 
 
 		 326 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  53.4 
 
 		 325 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  52.78 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  52.65 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  51.54 
 
 		 325 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  50.62 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  48.46 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  48.62 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  48.46 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  46.84 
 
 		 331 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  47.84 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  48.33 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  50.95 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  43.89 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  46.91 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  46.6 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  43.38 
 
 		 353 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  44.83 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  45.93 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  41.85 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  42.46 
 
 		 324 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  42.77 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  41.54 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  41.82 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  43.21 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  42.27 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  42.14 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 335 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  41.32 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  42.22 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  42.32 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  40.67 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  43.49 
 
 		 336 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  43.3 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  40.75 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  39.13 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  38.99 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  38.68 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  38.68 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  38.28 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  47.81 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  37.07 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  37.46 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  38.36 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  47.43 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 		 316 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 		 312 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.61 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.26 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>