274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1558 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 447 aa  872    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  99.6 
 
 		 324 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  88.8 
 
 		 324 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  79.28 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  63.2 
 
 		 335 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  63.6 
 
 		 325 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  61.2 
 
 		 342 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  59.92 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  55.21 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  53.47 
 
 		 324 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  52.78 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  57.94 
 
 		 332 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  51.72 
 
 		 326 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  57.94 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  58.47 
 
 		 323 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  57.14 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  57.2 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  53.57 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  52.08 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  50.36 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  46.21 
 
 		 337 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  45.85 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  49.64 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  49.64 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  43.4 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  46.8 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  49 
 
 		 325 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  48.59 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  46.67 
 
 		 326 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  46.67 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  46.27 
 
 		 326 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  47.81 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  47.81 
 
 		 324 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  44.19 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  47.41 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  47.41 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  47.41 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  45.91 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  44.8 
 
 		 327 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  46.09 
 
 		 324 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  48.4 
 
 		 336 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  41.18 
 
 		 331 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  46.67 
 
 		 333 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  44.4 
 
 		 327 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  45.95 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  45.32 
 
 		 324 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  47.81 
 
 		 329 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  42.96 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 332 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 332 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 332 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  42.22 
 
 		 332 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  42.22 
 
 		 332 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  41.85 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  43.19 
 
 		 325 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  41.63 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  42.12 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  41.87 
 
 		 351 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  39.13 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  35.97 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  44.92 
 
 		 223 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  35.32 
 
 		 322 aa  99.8  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 299 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 		 314 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.87 
 
 		 300 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.47 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 314 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.97 
 
 		 306 aa  90.5  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.87 
 
 		 315 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 		 312 aa  87.8  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 307 aa  87.8  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 		 341 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  31.3 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.46 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  32.17 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  28.29 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.66 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>