More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4479 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 337 aa  686    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  78.88 
 
 		 336 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  63.03 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  60.78 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  60.48 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  60.48 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  60.99 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  58.43 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  61.3 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  53.92 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  52.96 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  54.26 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  53.46 
 
 		 342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  54.26 
 
 		 325 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  52.02 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  51.23 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  50.63 
 
 		 324 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  50.32 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  50.79 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  49.37 
 
 		 326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  53.73 
 
 		 325 aa  315  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  49.84 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  49.53 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  51.56 
 
 		 324 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  45.94 
 
 		 323 aa  279  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  47.68 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  45.17 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  46.11 
 
 		 326 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  44.86 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  43.3 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  41.74 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  46.21 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  44.06 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  42.11 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  41.32 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  41.64 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  41.01 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  41.01 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  41.01 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  40.87 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  42.27 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  41.25 
 
 		 333 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  41.93 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  42.77 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  42.99 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  40.74 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  41.91 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  41.96 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  41.96 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  39.43 
 
 		 329 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  42.28 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  39.48 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  37.73 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  35.62 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  41.45 
 
 		 223 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  33.13 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.69 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.4 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  31.99 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  31.55 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  32.51 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.82 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.82 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  33.03 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  28.17 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  31.45 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  33.94 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.4 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.25 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>