More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2099 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  97.31 
 
 		 335 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 335 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  97.31 
 
 		 335 aa  656    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  79.04 
 
 		 335 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  64.67 
 
 		 336 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  60.78 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  61.92 
 
 		 336 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  60.36 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  59.33 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  58.59 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  54.37 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  54.97 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  53.75 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  56.11 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  50.47 
 
 		 342 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  52.83 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  53.42 
 
 		 324 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  51.57 
 
 		 325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  49.84 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  48.9 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  49.21 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  48.36 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  48.06 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  47.8 
 
 		 346 aa  289  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  47.17 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  45.79 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  50.36 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  43.26 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  44.1 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  43.79 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  44.1 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  41.3 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  43.34 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  42.24 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  42.28 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  41.67 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  43.09 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  43.12 
 
 		 336 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  42.55 
 
 		 325 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  42.24 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  43.09 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  39.37 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  38.99 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  39.05 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  39.05 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  39.05 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  40.63 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  39.62 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  39.68 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  40.95 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  40.95 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  40.95 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  40.32 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  39.08 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  38.51 
 
 		 337 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  41.27 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  41.27 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  39.09 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  38.14 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  36.56 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  39.34 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.86 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.34 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.34 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.89 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.75 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>