More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0191 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 339 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  57.37 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  54.14 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  54.76 
 
 		 335 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  54.46 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  54.49 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  54.46 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  54.46 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  51.36 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  50.93 
 
 		 332 aa  345  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  50.62 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  51.58 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  50.77 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 324 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  50.62 
 
 		 325 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  49.21 
 
 		 353 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  50.94 
 
 		 326 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  48.19 
 
 		 335 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  48.45 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  48.43 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  51.9 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  50.31 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  47.48 
 
 		 346 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  48.74 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  48.11 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  45.31 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  39.31 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  38.99 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  44.53 
 
 		 447 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  37.42 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  38.68 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  39.16 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  39.16 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  39.16 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  38.05 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  39.16 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  36.16 
 
 		 326 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  35.85 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  38.68 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  38.02 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  40.51 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  39.31 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  37.58 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  38.67 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  38.68 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  38.68 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  38.51 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  38.61 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  39.24 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  39.24 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  39.24 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  38.36 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 		 324 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  38.33 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  38.29 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  36.13 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  37.97 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  34.67 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 327 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  31.21 
 
 		 359 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  34.59 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  36.11 
 
 		 223 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  31.62 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.74 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.62 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.36 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.46 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  25.78 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.36 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  27.66 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  27.68 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  25.63 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.79 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>