More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0234 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 325 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  69.54 
 
 		 324 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  65.54 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  64.94 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  68.31 
 
 		 324 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  64.62 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  62.88 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  64.78 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  60.55 
 
 		 326 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  57.85 
 
 		 331 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  60 
 
 		 326 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  59.69 
 
 		 326 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  58.77 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  57.54 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  57.98 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  55.24 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  42.33 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  44.31 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  44.31 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  42.77 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  47.69 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  47.69 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  47.38 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  46.46 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  45.45 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  46.77 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  46.15 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  46.15 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  44.83 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  45.85 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  45.85 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  42.5 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  45.85 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  41.82 
 
 		 342 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  45.54 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  44.17 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  45.23 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  45.29 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  41.67 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  44.74 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  41.51 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  42.06 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  43.61 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  46.32 
 
 		 329 aa  255  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  43.21 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  43.22 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  42.28 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  43.08 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  44 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  40.31 
 
 		 323 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  41.18 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  40.31 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  58.15 
 
 		 223 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  38.24 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  43.19 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  38.68 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  34.36 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  33.44 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.88 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  32.4 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.23 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 		 305 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.41 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 316 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 301 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  23.15 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>