More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4006 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
317 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  74.15 
 
 
315 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  73.4 
 
 
349 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  73.47 
 
 
315 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  71.79 
 
 
315 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  70.03 
 
 
323 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  68.69 
 
 
323 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  69.93 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  69.02 
 
 
317 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  68.28 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  45.45 
 
 
313 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  43.59 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  42.48 
 
 
312 aa  239  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  38.8 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  38.33 
 
 
302 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  40.13 
 
 
312 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
311 aa  186  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  34.3 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  34.3 
 
 
319 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  29.18 
 
 
414 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 
325 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
298 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  23.7 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  26.18 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
307 aa  95.5  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  23.55 
 
 
426 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  23.13 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 
314 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  26.45 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08718  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02620)  24.53 
 
 
711 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 
311 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  27 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  23.82 
 
 
367 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08494  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  23.87 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  31.14 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34207  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  23.03 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391649  normal  0.984982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  25.98 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.47 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.84 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.54 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  26.84 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01220  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  23.55 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  24.03 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  24 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  23.4 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  24.45 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  22.82 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  26.49 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  23.93 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  23.66 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  26.82 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63020  predicted protein  23.89 
 
 
365 aa  72.4  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.420231  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  23.87 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  27.38 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  25.17 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  29.46 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  24.54 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  26.37 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>