273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0833 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  45.58 
 
 
296 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  45.24 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  45.92 
 
 
298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  45.92 
 
 
297 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  46.26 
 
 
298 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  46.28 
 
 
319 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  46.28 
 
 
295 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  46.96 
 
 
298 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  47.14 
 
 
298 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  45.95 
 
 
296 aa  224  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  45.08 
 
 
296 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  45.24 
 
 
298 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  45.92 
 
 
298 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  45.24 
 
 
298 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  46.26 
 
 
298 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  44.9 
 
 
298 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  53.09 
 
 
275 aa  221  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  48.4 
 
 
335 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  41.1 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  38.91 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 
286 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 
286 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.07 
 
 
299 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 
289 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
329 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.14 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  33.48 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  32.37 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.71 
 
 
316 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  24.09 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.22 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  24.51 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  28.53 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  25.48 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.97 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  27.2 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  31.32 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  28.69 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>