More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2622 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  58.72 
 
 
289 aa  354  6.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  28.14 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 
297 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
298 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 
298 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 
296 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 
296 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  26.96 
 
 
297 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  24.66 
 
 
298 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 
296 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 
298 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 
298 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 
298 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 
298 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  26.26 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 
296 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 
335 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  25.09 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  23.41 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  23 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  24.38 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  24.7 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  24.11 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  24.28 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  24.69 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  23.01 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  23.69 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  22.15 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  23.69 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  23.38 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  23.39 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  22.05 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  21.75 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  24.57 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  24 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  22.3 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  23.87 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  23.41 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  22.65 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  24.14 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  23.23 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  22.42 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  23.6 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  23.78 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  25.39 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  21.43 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  25.11 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  25.53 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  24.79 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  22.15 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  22.74 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  22.6 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  23.79 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  23.53 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  22.81 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  25.65 
 
 
312 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  26.54 
 
 
426 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  23.53 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  22.74 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  28.23 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  22.74 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  22.74 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  28.23 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  23.61 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  26.18 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  22.96 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  24.4 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>