288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2153 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  58.72 
 
 		 286 aa  354  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  58.72 
 
 		 286 aa  354  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  24.74 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  24.74 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  25.09 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  26.03 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  26.22 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  24.05 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  24.05 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  23.26 
 
 		 319 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  23.26 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  26.92 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  23.96 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  22.03 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  22.76 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  21.71 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  25.26 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  23.45 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  21.88 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  24.45 
 
 		 335 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  23.2 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  23.17 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  22.46 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  24.16 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  22.18 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  23.51 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  23.05 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  23.4 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  23.4 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  22.18 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  22.81 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  23.27 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  21.09 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  24.08 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  23.67 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  22.57 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  25.26 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  22.27 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  23.97 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  20.62 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  22.61 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  21.5 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  22.47 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  22.64 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  23.59 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  23.75 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  21.41 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  21.88 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  27.03 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  19.94 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  21.43 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  23.83 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  21.66 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  21.79 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  23.62 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  25.17 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  19.73 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  21.77 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  20.41 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  21.89 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  19.3 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  23.55 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  24.66 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  25.7 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  24.33 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  20.31 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  23.28 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  19.93 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  22.39 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  20.69 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  21.09 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  22.57 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  21.79 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  21.79 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.14 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  21.16 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  25.34 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>