More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3881 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 310 aa  594  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1046  2-dehydropantoate 2-reductase  47.97 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0275779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  32.03 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  32.3 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  26.15 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  32.3 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  35.84 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  35.04 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  35.04 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  35.13 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  25.74 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  25.74 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  25.74 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  25.37 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  30.47 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.07 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  34.48 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.49 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.14 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.65 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.55 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.18 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  30.27 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.29 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  31.45 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  31.93 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  31.18 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  30.11 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  34.75 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.71 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  31.54 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.65 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  30.17 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  30.39 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.47 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.51 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  28.47 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  30.93 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  24.67 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.76 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  21.55 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  31.71 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  30.47 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  24.67 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.5 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  30.2 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  22.81 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  26.85 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  30.52 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>