295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2354 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  99.66 
 
 
319 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  63.27 
 
 
275 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  58.92 
 
 
298 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  58.9 
 
 
298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  58.7 
 
 
298 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  55.33 
 
 
296 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  54.3 
 
 
297 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  54.64 
 
 
298 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  53.95 
 
 
298 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  54.3 
 
 
298 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  53.95 
 
 
298 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  52.23 
 
 
296 aa  291  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  53.26 
 
 
298 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  53.61 
 
 
298 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  53.26 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  51.89 
 
 
296 aa  280  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  46.28 
 
 
297 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  39.38 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  37.11 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  39.67 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
299 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 
300 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
301 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  30.85 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.87 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.29 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  23.26 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.64 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 
301 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 
315 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  29.54 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.45 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  24.36 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.04 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  28.07 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  26.34 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.82 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  23.75 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  24.03 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  24.08 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  23.4 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  22.83 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  23.97 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  26.82 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  23.65 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  23.03 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  23.03 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  23.62 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  24.58 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  23.63 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>