235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2165 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  56.1 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  38.91 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  36.55 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  38.19 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  37.85 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  36.33 
 
 		 298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  36.11 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  39.1 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  37.5 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  36.46 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  37.85 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  37.37 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  37.11 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  37.11 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  37.85 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  35.07 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  38.39 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  37.2 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.44 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.31 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  22.03 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  23.41 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  23.41 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  25.49 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.52 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  24.09 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  26.47 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.55 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  28.95 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  28.76 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  23.84 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  26.38 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  24.17 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  22.95 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  23.1 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  23.51 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  22.12 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  29.36 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  26.27 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.2 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  22.58 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  27.92 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.87 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  29.82 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  24.75 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  25.4 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  27.41 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  25.88 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.44 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>