195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12593 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  63.27 
 
 		 295 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  63.27 
 
 		 319 aa  341  7e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  56.36 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  57.09 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  52.73 
 
 		 298 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  53.09 
 
 		 297 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  52 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  55.27 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  51.64 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  50.55 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  51.27 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  51.27 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  50.91 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  52 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  49.09 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  50.18 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  53.09 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  41.22 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  42.56 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  38.39 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.64 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  34.31 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  34.04 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.91 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.58 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.41 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  30.08 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.88 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.94 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  29.79 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.03 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  30.93 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  28.51 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  21.84 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  25.56 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  24.48 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  23.25 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  22.4 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  22.86 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  28.51 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  23.85 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  24.52 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  21.57 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.12 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.02 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.58 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  28.23 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  25.87 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01220  conserved hypothetical protein  24 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  24.23 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  27.51 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  24.72 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  20.45 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  24.17 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  26.36 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  23.05 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 319 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>