More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1790 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 332 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  98.3 
 
 		 312 aa  544  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  90.2 
 
 		 312 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  45.85 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  45.67 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  47.18 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  37.54 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.96 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  33.58 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  33.04 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.13 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  31.4 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.71 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 324 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  33.05 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  28.42 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.38 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  31.39 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  35.37 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  35.15 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.03 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  31.11 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.11 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  25.78 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  24.65 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  25.35 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.73 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  27.9 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  25.44 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  25.26 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  25.44 
 
 		 314 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  36.92 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.08 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  33.91 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  32.17 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  29.82 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.81 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  32.31 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.31 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  23.98 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  27.31 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>