More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0462 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
303 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 
303 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 
309 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
303 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
303 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  30.87 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
303 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 
316 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  34.54 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  29.29 
 
 
303 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 
296 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 
305 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  35.79 
 
 
294 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 
311 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  29.51 
 
 
319 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 
312 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
295 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
295 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 
296 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  30.39 
 
 
293 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 
294 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 
310 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
305 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 
326 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 
302 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 
296 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 
280 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
305 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
313 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
305 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
305 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 
294 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 
311 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  31.54 
 
 
319 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
305 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 
326 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
327 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 
300 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 
320 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 
302 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  25.88 
 
 
318 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 
296 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  34.11 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.48 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  30.32 
 
 
305 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  33.79 
 
 
282 aa  94  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 
319 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 
319 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  30.32 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
306 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
315 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 
305 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 
302 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 
322 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 
283 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  32.59 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  28.74 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 
343 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>