188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5159 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 298 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  77.52 
 
 		 298 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  76.69 
 
 		 297 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  77.85 
 
 		 298 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  76.85 
 
 		 298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  75.84 
 
 		 298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  75.84 
 
 		 298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  67.57 
 
 		 296 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  68.24 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  65.54 
 
 		 296 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  65.54 
 
 		 296 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  66.22 
 
 		 298 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  61.74 
 
 		 298 aa  355  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  62.54 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  54.64 
 
 		 295 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  54.64 
 
 		 319 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  51.64 
 
 		 275 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  46.26 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  37.85 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  35.42 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  35.42 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  25.09 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.89 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.62 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  24.08 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.86 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  29.12 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.53 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  25.36 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.36 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  21.17 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  28.46 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  30.29 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  21.29 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  26.15 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  27.85 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  22.22 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.82 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  27.31 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.82 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  22.67 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  22.67 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  26.83 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  24.25 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  27.57 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  22.68 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  23.75 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  23.38 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  24.09 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  24.59 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  24 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  23.2 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  21.81 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  24.67 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  24.81 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  21.54 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  23.4 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  27.95 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  26.94 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  22.85 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.61 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  25.95 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>