155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1469 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  83.78 
 
 		 296 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  82.77 
 
 		 296 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  81.08 
 
 		 296 aa  490  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  72.64 
 
 		 297 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  71.19 
 
 		 298 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  70.85 
 
 		 298 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  70.51 
 
 		 298 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  70.85 
 
 		 298 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  70.85 
 
 		 298 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  68.24 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  65.17 
 
 		 298 aa  362  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 298 aa  355  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  63.57 
 
 		 298 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  55.33 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  55.33 
 
 		 319 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  52 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  45.24 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  37.37 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  36.05 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  26.22 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.34 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  25.58 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  25.58 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  30.04 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.93 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  23.36 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  24.48 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  25.17 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  26.05 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  26.74 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  23.43 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  25.41 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  24.59 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  25.89 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01220  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  24.42 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  22.74 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  22.74 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  26.82 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  22.04 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  22.61 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  22.76 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  24.1 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  25.11 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  26.38 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  22.87 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.18 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  25.74 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  21.86 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  23.31 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  28.82 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  25.34 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 		 317 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  24.01 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  24.26 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0800  2-dehydropantoate 2-reductase  22.88 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  23 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  20.91 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  25.51 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  20.86 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  25.56 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  19.82 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.58 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  24.5 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>