More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4530 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 355 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  66.38 
 
 		 351 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  34.36 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.36 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  33.53 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  32.11 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  31.52 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  34.36 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  32.02 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  33.43 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6340  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3557  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 		 343 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.63 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  27.57 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  26.61 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 		 309 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  31.61 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 		 312 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 285 aa  93.2  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  25.55 
 
 		 302 aa  90.5  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  24.49 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 301 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.78 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.3 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  27.64 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.78 
 
 		 295 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  23.56 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  29.54 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  25.83 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  29.54 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  27.79 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  24.93 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  21.73 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  23.03 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  22.75 
 
 		 307 aa  79.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.03 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  23.15 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  25.39 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  23.85 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  25.07 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  20.55 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  26.83 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  25.99 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  23.05 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>