243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3557 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3557  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
343 aa  703    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34380  ketopantoate reductase  36.36 
 
 
368 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0495871  normal  0.346815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6340  2-dehydropantoate 2-reductase  27.03 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
351 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
355 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.71 
 
 
335 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  23.55 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  23.55 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.52 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  30.5 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.22 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  25.47 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.47 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  25.47 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  25.47 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  24.16 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  25.47 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.02 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  29.8 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.15 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  26.53 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  28.82 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.74 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.74 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  28.74 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.74 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.74 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  26.53 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  28.88 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  26 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  23.37 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.95 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  26.53 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.95 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.32 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  24.52 
 
 
308 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  28.78 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  22.02 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  24.56 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  24.36 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  23.03 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  26.41 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  24.54 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.41 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  23.7 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  20.73 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  24.93 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  24.93 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  23.9 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.09 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 
312 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 
306 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  24.86 
 
 
335 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  26.41 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  28.69 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  23.78 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>