250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1739 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  100 
 
 		 334 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  100 
 
 		 334 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  98.8 
 
 		 334 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  100 
 
 		 334 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  100 
 
 		 334 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  99.4 
 
 		 334 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  42.94 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  38.34 
 
 		 315 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  29.52 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  37.7 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 306 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.51 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.13 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.13 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 		 310 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.36 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  34.03 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  28.65 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  28.27 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  34.55 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.24 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  25.68 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  29.88 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  33.51 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  34.47 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  25.69 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  25.84 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  23.66 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  24.65 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  30.75 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  30.75 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  30.95 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.75 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  25.68 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  28.69 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  24.77 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  26.59 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3557  2-dehydropantoate 2-reductase  28.74 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  30.75 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  33.95 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  30.75 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  26.98 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  25.82 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  23.42 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.95 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  26.43 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  24.77 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16020  ketopantoate reductase  30.1 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.431175  hitchhiker  0.000000288636 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  25.15 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30.21 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  25.61 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  25.44 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.01 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  25.76 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  22.55 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>