More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1285 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 311 aa  633  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 309 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  48.22 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  46.75 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  46.45 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 		 305 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 		 305 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  37.99 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  37.99 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  36.13 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  36.66 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  34.42 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  33.01 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  33.01 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1333  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.782684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  27.5 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1867  2-dehydropantoate 2-reductase  25.4 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 		 295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.77 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0258  ketopantoate reductase  25.87 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.466283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  26.86 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.91 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  25.17 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  23.97 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  24.67 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  25.82 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  24.58 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 303 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 303 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 303 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  23.7 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  27.6 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  24.42 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  22 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  23.47 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  27.89 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  26.53 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  23.86 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  24.68 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  26.16 
 
 		 285 aa  85.9  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  25.24 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  25.47 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>