More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3518 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 305 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  57.7 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  55.81 
 
 		 311 aa  321  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  57.14 
 
 		 311 aa  315  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  53.27 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  51.94 
 
 		 312 aa  301  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  50.64 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  54.46 
 
 		 305 aa  298  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  50.96 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  52.9 
 
 		 315 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  52.13 
 
 		 306 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  50.49 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  52.56 
 
 		 315 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  52.56 
 
 		 315 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  52.56 
 
 		 315 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  52.13 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  51.92 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  50.66 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  53.23 
 
 		 315 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  50.81 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  52.46 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  52.87 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  52.81 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  51.78 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  49.84 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  50.48 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  52.15 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  45.48 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  48.55 
 
 		 312 aa  254  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  48.23 
 
 		 312 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  49.36 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  49.04 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  49.84 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  43.42 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  41.37 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  49.36 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  49.2 
 
 		 312 aa  222  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  42.35 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  42.3 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  44.63 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  42.48 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  38.95 
 
 		 314 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  37.33 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  38.01 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  36.99 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  38.6 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  38.6 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  38.6 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  37.54 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  41.42 
 
 		 307 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  38.62 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  41.99 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  40.52 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.57 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  32.25 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  30.17 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  32.25 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  32.65 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  30.21 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  33.59 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.79 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.27 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.27 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  28.27 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  25.89 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.42 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.42 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.42 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  31.85 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.28 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.07 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.66 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>