261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1095 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 312 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  39.48 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  39.91 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  36.76 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  35.59 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  37.28 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  35.5 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  35.65 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  35.65 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  35.65 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  38.2 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  36.8 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  36.52 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  35.93 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  35.14 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.17 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.17 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  34.22 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  33.2 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  32.07 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  37.78 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  32.49 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  30.47 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 343 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  25.68 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  26.46 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  30.93 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  35.12 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  26.58 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  27.41 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  26.25 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  27.78 
 
 		 424 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.18 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.69 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.94 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.69 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  28.63 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  26.61 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.53 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  25.11 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  23.02 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  26.61 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  21.54 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  25.64 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  23.68 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  28.4 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  27 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.11 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  27 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.51 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  23.25 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  24.35 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>