74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63020 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63020  predicted protein  100 
 
 
365 aa  745    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.420231  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34207  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  33.53 
 
 
351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391649  normal  0.984982 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  30.19 
 
 
367 aa  152  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08494  conserved hypothetical protein  27 
 
 
389 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  24.62 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  25.33 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  24.38 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  23.44 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03630  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  24.24 
 
 
323 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  22.6 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  21.81 
 
 
315 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  23.04 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  21.54 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  24.06 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  21.48 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  22.6 
 
 
311 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  22.86 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01220  conserved hypothetical protein  21.97 
 
 
295 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  23.89 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  21.81 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  21.48 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  21.67 
 
 
315 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  24.01 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  25.74 
 
 
314 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  22.09 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  21.19 
 
 
315 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  22.03 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  22.17 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  23.53 
 
 
307 aa  50.4  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 
305 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  21.8 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 
305 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 
305 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  20.67 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  20.67 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  22.28 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  21.5 
 
 
335 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  19.11 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  21.5 
 
 
335 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  22.99 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  25.21 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 
314 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.09 
 
 
310 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  22.99 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  27.5 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  20.51 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0258  ketopantoate reductase  23.1 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.466283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  23.62 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  20.06 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  24.56 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  20.06 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  20.33 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  22.64 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  22.35 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  19.76 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  23.62 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  25.54 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  25.79 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  21.21 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  20.17 
 
 
294 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
314 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
314 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 
314 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25.74 
 
 
301 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  24.18 
 
 
333 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 
314 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 
314 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>