More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4737 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 330 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3175  2-dehydropantoate 2-reductase  54.19 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  45.81 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0936  2-dehydropantoate 2-reductase  47.25 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2141  2-dehydropantoate 2-reductase  47.25 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2264  2-dehydropantoate 2-reductase  47.25 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1092  2-dehydropantoate 2-reductase  47.25 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0940  2-dehydropantoate 2-reductase  47.25 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0561  2-dehydropantoate 2-reductase  47.25 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  45.6 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  39.02 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0749  2-dehydropantoate 2-reductase  47.73 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770799  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  45.45 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  45.45 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2457  2-dehydropantoate 2-reductase  48.39 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000431048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2587  2-dehydropantoate 2-reductase  47.74 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  47.42 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5870  2-dehydropantoate 2-reductase  48.06 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166245  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  45.89 
 
 		 370 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2539  2-dehydropantoate 2-reductase  45.89 
 
 		 376 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0800  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1772  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1081  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  37.06 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.87 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  35.58 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  34.29 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  34.04 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  35.24 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.18 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  30.06 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.03 
 
 		 299 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.84 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  30.65 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  32.4 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.27 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2052  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  26.69 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.18 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  32.51 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  28.78 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  28.36 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  28.74 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.37 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  35 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  28.35 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.68 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  32.1 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.44 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  31.69 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  27.38 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.44 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  28.44 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.44 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>