156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2052 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2052  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
344 aa  671    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  22.78 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  22.78 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  29.54 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  26.9 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.08 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.85 
 
 
300 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
313 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  28.74 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  24.7 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.17 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  28.17 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  29.48 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.35 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2457  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 
351 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000431048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  24.15 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2587  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  24 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  24 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  24 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
319 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 
316 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  22.32 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 
299 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 
310 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.56 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.27 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.82 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 
316 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  28.88 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 
278 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  32.66 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  25.51 
 
 
315 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  22.94 
 
 
309 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 
306 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  25.51 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  23.12 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0800  2-dehydropantoate 2-reductase  24.25 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  21.2 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  26.07 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  32.74 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  21.34 
 
 
311 aa  53.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  24.27 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  30.05 
 
 
307 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2264  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0561  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0940  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2141  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1092  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109673  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  25.86 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0936  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1081  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.43 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.43 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.17 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 
314 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  26.47 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  30.71 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  30.71 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  26.51 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
355 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 
351 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>