236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3116 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  100 
 
 		 339 aa  678    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  57.28 
 
 		 328 aa  301  8.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  50.94 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  45.28 
 
 		 627 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  43.84 
 
 		 687 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5177  Ketopantoate reductase  36.28 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.63 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.03 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  30.64 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  28.5 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  40.35 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  42.98 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.47 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.47 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  25.3 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  30.4 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.52 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.12 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  40.79 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  29.54 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  29.21 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  44.94 
 
 		 447 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  26.5 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  29.44 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  29.44 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  25.93 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  44.94 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  42.42 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  28.35 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  26.12 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  40.35 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  26.24 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.33 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  30.35 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  26.81 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  37.39 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  24.3 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  27.75 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  24.3 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  49.45 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  30.47 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  27.68 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  36.21 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.68 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  30.05 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  36.21 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  32.68 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.68 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>